Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX2Q04743 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms