Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX1Q04741 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms