Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7AQ04656 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms