Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RELAQ04206 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELAQ04206 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELAQ04206 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELAQ04206 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELAQ04206 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RELAQ04206 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RELAQ04206 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RELAQ04206 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms