Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFITM3Q01628 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms