Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA5Q01523 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA5Q01523 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA5Q01523 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA5Q01523 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms