Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM2Q00987 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms