Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK16Q00536 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms