Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL1Q00532 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms