Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXO4P98177 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXO4P98177 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXO4P98177 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms