Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMF1P82094 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TMF1P82094 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMF1P82094 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMF1P82094 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMF1P82094 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMF1P82094 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMF1P82094 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMF1P82094 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMF1P82094 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMF1P82094 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMF1P82094 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMF1P82094 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMF1P82094 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMF1P82094 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMF1P82094 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMF1P82094 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TMF1P82094 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMF1P82094 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMF1P82094 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMF1P82094 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMF1P82094 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMF1P82094 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TMF1P82094 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TMF1P82094 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TMF1P82094 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMF1P82094 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMF1P82094 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMF1P82094 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMF1P82094 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms