Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM189BP81408 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM189BP81408 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms