Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB2P80303 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms