Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL8P80075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL8P80075 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL8P80075 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL8P80075 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL8P80075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL8P80075 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL8P80075 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL8P80075 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL8P80075 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL8P80075 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL8P80075 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL8P80075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL8P80075 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL8P80075 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL8P80075 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL8P80075 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL8P80075 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL8P80075 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL8P80075 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms