Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEP78395 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms