Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC1P78348 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC1P78348 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC1P78348 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms