Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL11P62913 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL11P62913 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL11P62913 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL11P62913 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL11P62913 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL11P62913 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms