Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBX1P62877 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBX1P62877 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBX1P62877 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBX1P62877 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms