Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS13P62277 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS13P62277 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS13P62277 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS13P62277 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS13P62277 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS13P62277 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS13P62277 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS13P62277 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS13P62277 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS13P62277 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS13P62277 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS13P62277 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS13P62277 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS13P62277 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS13P62277 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS13P62277 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS13P62277 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS13P62277 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS13P62277 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS13P62277 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS13P62277 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms