Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VBP1P61758 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VBP1P61758 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VBP1P61758 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VBP1P61758 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VBP1P61758 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VBP1P61758 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VBP1P61758 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VBP1P61758 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VBP1P61758 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VBP1P61758 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VBP1P61758 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms