Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM258P61165 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TMEM258P61165 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TMEM258P61165 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TMEM258P61165 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TMEM258P61165 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TMEM258P61165 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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