Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms