Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms