Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms