Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEFSECP57772 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms