Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF3P57682 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF3P57682 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF3P57682 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF3P57682 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF3P57682 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF3P57682 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF3P57682 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF3P57682 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
KLF3P57682 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF3P57682 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms