Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms