Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ARL4CP56559 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms