Protein–RNA interactions for Protein: P56385

ATP5I, ATP synthase subunit e, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5IP56385 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5IP56385 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5IP56385 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms