Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTSWP56202 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTSWP56202 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTSWP56202 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTSWP56202 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTSWP56202 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSWP56202 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSWP56202 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTSWP56202 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTSWP56202 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTSWP56202 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTSWP56202 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTSWP56202 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTSWP56202 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTSWP56202 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTSWP56202 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTSWP56202 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTSWP56202 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTSWP56202 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSWP56202 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTSWP56202 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTSWP56202 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CTSWP56202 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTSWP56202 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTSWP56202 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTSWP56202 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTSWP56202 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CTSWP56202 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CTSWP56202 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTSWP56202 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSWP56202 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms