Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FCGRTP55899 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FCGRTP55899 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCGRTP55899 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms