Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP7P55210 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP7P55210 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP7P55210 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP7P55210 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP7P55210 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP7P55210 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP7P55210 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP7P55210 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP7P55210 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP7P55210 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP7P55210 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms