Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEMP55040 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEMP55040 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEMP55040 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GEMP55040 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEMP55040 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEMP55040 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEMP55040 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEMP55040 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GEMP55040 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEMP55040 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEMP55040 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEMP55040 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEMP55040 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEMP55040 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GEMP55040 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GEMP55040 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEMP55040 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEMP55040 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEMP55040 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEMP55040 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GEMP55040 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GEMP55040 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GEMP55040 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GEMP55040 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEMP55040 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEMP55040 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms