Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GYS2P54840 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GYS2P54840 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GYS2P54840 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GYS2P54840 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GYS2P54840 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GYS2P54840 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GYS2P54840 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GYS2P54840 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GYS2P54840 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GYS2P54840 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GYS2P54840 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GYS2P54840 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GYS2P54840 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GYS2P54840 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GYS2P54840 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GYS2P54840 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GYS2P54840 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GYS2P54840 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GYS2P54840 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GYS2P54840 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GYS2P54840 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GYS2P54840 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms