Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN5P54829 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN5P54829 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN5P54829 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN5P54829 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms