Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRX1P54821 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms