Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D1P54289 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D1P54289 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms