Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATN1P54259 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATN1P54259 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATN1P54259 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATN1P54259 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATN1P54259 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATN1P54259 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATN1P54259 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms