Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN3P54252 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms