Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARSP54136 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARSP54136 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARSP54136 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RARSP54136 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RARSP54136 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RARSP54136 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARSP54136 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARSP54136 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARSP54136 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARSP54136 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARSP54136 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARSP54136 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARSP54136 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARSP54136 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARSP54136 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RARSP54136 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RARSP54136 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RARSP54136 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RARSP54136 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RARSP54136 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARSP54136 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARSP54136 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARSP54136 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARSP54136 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARSP54136 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARSP54136 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARSP54136 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARSP54136 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARSP54136 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARSP54136 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARSP54136 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARSP54136 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARSP54136 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms