Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP98P52948 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP98P52948 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP98P52948 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP98P52948 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP98P52948 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP98P52948 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP98P52948 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP98P52948 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP98P52948 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP98P52948 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP98P52948 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP98P52948 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP98P52948 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP98P52948 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP98P52948 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP98P52948 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP98P52948 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP98P52948 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP98P52948 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP98P52948 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP98P52948 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP98P52948 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP98P52948 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP98P52948 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP98P52948 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP98P52948 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP98P52948 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP98P52948 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms