Protein–RNA interactions for Protein: P51970

NDUFA8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA8P51970 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDUFA8P51970 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA8P51970 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA8P51970 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms