Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KA3P51812 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms