Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN6P51797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms