Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR5P51681 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR5P51681 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR5P51681 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR5P51681 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR5P51681 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR5P51681 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR5P51681 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR5P51681 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR5P51681 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR5P51681 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR5P51681 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR5P51681 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms