Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5CP51148 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5CP51148 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5CP51148 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms