Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRP3P50461 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms