Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IDH3AP50213 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms