Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSEN2P49810 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms