Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUP153P49790 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NUP153P49790 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUP153P49790 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUP153P49790 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUP153P49790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUP153P49790 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUP153P49790 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP153P49790 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP153P49790 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP153P49790 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP153P49790 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP153P49790 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NUP153P49790 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUP153P49790 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NUP153P49790 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NUP153P49790 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP153P49790 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP153P49790 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP153P49790 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP153P49790 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP153P49790 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP153P49790 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUP153P49790 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP153P49790 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP153P49790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP153P49790 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP153P49790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP153P49790 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP153P49790 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms